Полномочия органов государственной власти и органов местного самоуправления на территории долины будут осуществляться в ограниченном объеме.

Кроме того, предполагается, что участникам проекта Технологической долины будут предоставлены гарантии от неблагоприятных изменений налогового законодательства: акты законодательства РФ, законы субъектов РФ, нормативные правовые акты органов местного самоуправления о налогах и сборах, ухудшающие положение налогоплательщиков - участников проекта, за исключением актов законодательства РФ о налогах и сборах, касающихся налогообложения подакцизных товаров, не будут применяться в отношении участников проекта с момента их внесения в реестр участников и до момента утраты статуса участника проекта